Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ZNRF3Q9ULT6 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms