Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms