Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FBXL4Q9UKA2 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106 ms