Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIG8

SLCO3A1, Solute carrier organic anion transporter family member 3A1, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO3A1Q9UIG8 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLCO3A1Q9UIG8 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms