Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CTNNA3Q9UI47 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTNNA3Q9UI47 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms