Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms