Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RNF7Q9UBF6 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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