Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CEP44Q9C0F1 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms