Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.05■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.05■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.05■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AMBRA1Q9C0C7 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms