Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CIPCQ9C0C6 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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