Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 BLVRA-201ENST00000265523 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 AC002127.2-201ENST00000444032 792 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 SNRPF-205ENST00000553192 552 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP2-4Q9BYR9 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms