Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCAPERQ9BY12 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms