Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CARD11Q9BXL7 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms