Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HIRIP3Q9BW71 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HIRIP3Q9BW71 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms