Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV19

C1orf50, Uncharacterized protein C1orf50, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf50Q9BV19 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C1orf50Q9BV19 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C1orf50Q9BV19 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C1orf50Q9BV19 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C1orf50Q9BV19 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C1orf50Q9BV19 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C1orf50Q9BV19 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C1orf50Q9BV19 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C1orf50Q9BV19 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C1orf50Q9BV19 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C1orf50Q9BV19 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C1orf50Q9BV19 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C1orf50Q9BV19 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms