Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TREX2Q9BQ50 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms