Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAT1Q99536 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms