Protein–RNA interactions for Protein: Q96M34

C3orf30, Uncharacterized protein C3orf30, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf30Q96M34 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C3orf30Q96M34 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms