Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CNBD2Q96M20 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms