Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP47Q96K76 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP47Q96K76 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms