Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ2

CLMN, Calmin, humanhuman

Predictions only

Length 1,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMNQ96JQ2 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLMNQ96JQ2 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms