Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
COG3Q96JB2 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COG3Q96JB2 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms