Protein–RNA interactions for Protein: Q96GC9

VMP1, Vacuole membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VMP1Q96GC9 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms