Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHFRQ96EP1 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CHFRQ96EP1 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CHFRQ96EP1 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CHFRQ96EP1 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms