Protein–RNA interactions for Protein: Q96AY2

EME1, Crossover junction endonuclease EME1, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME1Q96AY2 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EME1Q96AY2 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms