Protein–RNA interactions for Protein: Q969S2

NEIL2, Endonuclease 8-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL2Q969S2 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEIL2Q969S2 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms