Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SMARCE1Q969G3 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms