Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCAMP4Q969E2 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms