Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BHMTQ93088 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms