Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAAF4Q8WXU2 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAAF4Q8WXU2 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms