Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
APOBEC4Q8WW27 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms