Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM35BQ8NCS4 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms