Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC84Q86UT8 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
CCDC84Q86UT8 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.58
CCDC84Q86UT8 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC84Q86UT8 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC84Q86UT8 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC84Q86UT8 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC84Q86UT8 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC84Q86UT8 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC84Q86UT8 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC84Q86UT8 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC84Q86UT8 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC84Q86UT8 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC84Q86UT8 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC84Q86UT8 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC84Q86UT8 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC84Q86UT8 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms