Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ATG4DQ86TL0 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ATG4DQ86TL0 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms