Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC141Q6ZP82 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC141Q6ZP82 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms