Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms