Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXD1

HRCT1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCT1Q6UXD1 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 WAPL-206ENST00000618527 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 CACNA1G-232ENST00000515411 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 PIM1-201ENST00000373509 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
HRCT1Q6UXD1 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms