Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

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Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SMARCD3Q6STE5 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SMARCD3Q6STE5 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SMARCD3Q6STE5 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SMARCD3Q6STE5 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SMARCD3Q6STE5 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SMARCD3Q6STE5 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SMARCD3Q6STE5 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SMARCD3Q6STE5 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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SMARCD3Q6STE5 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMARCD3Q6STE5 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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