Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LETMD1Q6P1Q0 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LETMD1Q6P1Q0 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms