Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CARMIL2Q6F5E8 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms