Protein–RNA interactions for Protein: Q68J44

DUPD1, Dual specificity phosphatase DUPD1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUPD1Q68J44 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUPD1Q68J44 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms