Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2R2

PDSS1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1Q5T2R2 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PDSS1Q5T2R2 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDSS1Q5T2R2 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDSS1Q5T2R2 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDSS1Q5T2R2 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDSS1Q5T2R2 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PDSS1Q5T2R2 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDSS1Q5T2R2 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PDSS1Q5T2R2 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PDSS1Q5T2R2 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDSS1Q5T2R2 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDSS1Q5T2R2 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDSS1Q5T2R2 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDSS1Q5T2R2 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDSS1Q5T2R2 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDSS1Q5T2R2 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDSS1Q5T2R2 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDSS1Q5T2R2 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDSS1Q5T2R2 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDSS1Q5T2R2 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDSS1Q5T2R2 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDSS1Q5T2R2 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDSS1Q5T2R2 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDSS1Q5T2R2 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDSS1Q5T2R2 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDSS1Q5T2R2 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDSS1Q5T2R2 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDSS1Q5T2R2 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDSS1Q5T2R2 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PDSS1Q5T2R2 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PDSS1Q5T2R2 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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