Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

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Length 151 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
C10orf55Q5SWW7 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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