Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LDLRAP1Q5SW96 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LDLRAP1Q5SW96 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.5 ms