Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TDRD12Q587J7 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms