Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms