Protein–RNA interactions for Protein: Q4AE62

GTDC1, Glycosyltransferase-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTDC1Q4AE62 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GTDC1Q4AE62 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GTDC1Q4AE62 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms