Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.05■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00303Q3SY05 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00303Q3SY05 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms