Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL40Q2TBA0 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms