Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
ATP6V1FQ16864 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms